Toutes les espèces de chiroptères (chauve-souris) présentes en France font l'objet d'une protection à la fois au niveau national et européen.
En 2008, l'OPE a lancé un inventaire des gîtes connus sur le territoire, ainsi qu'une campagne de recherche de nouvelles colonies et de nouveaux gîtes. Sur la base de ces premiers résultats, des campagnes de suivi des populations suivant le protocole Vigi-chiro du Muséum National d'Histoire Naturelle ont été démarrés en 2009.
A l'heure actuelle, les deux études cohabitent et sont régulièrement reconduites par l'OPE.